Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAPTM4AQ15012 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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