Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ODF1Q14990 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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