Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RFTN1Q14699 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN1Q14699 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RFTN1Q14699 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RFTN1Q14699 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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