Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD11Q14690 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms