Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCARF1Q14162 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF1Q14162 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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