Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CBFBQ13951 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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