Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
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SHROOM2Q13796 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHROOM2Q13796 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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