Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX3Q13761 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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