Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PICALMQ13492 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PICALMQ13492 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms