Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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