Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MKRN4PQ13434 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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