Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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