Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATMQ13315 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATMQ13315 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATMQ13315 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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