Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AIFM1-206ENST00000527892 2105 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RNF157-204ENST00000589912 286 ntTSL 210.12□□□□□ -0.795e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 ACSM3-211ENST00000567387 843 ntTSL 37.78□□□□□ -1.165e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 212.32□□□□□ -0.444e-71■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 DNM2-219ENST00000591818 538 ntTSL 416.3■□□□□ 0.23e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.119e-12■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AC015574.1-204ENST00000612595 512 ntTSL 55.78□□□□□ -1.489e-12■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 GPAA1-216ENST00000531593 543 ntTSL 319.92■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TCOF1-215ENST00000515516 661 ntTSL 516.61■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.22□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.798e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.468e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AC020915.1-208ENST00000590505 3889 ntTSL 27.87□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.47e-10■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.57e-10■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 516.99■□□□□ 0.311e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 311.77□□□□□ -0.531e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-38■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 317.47■□□□□ 0.391e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 RPS25-201ENST00000524864 1078 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-21■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.022e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 325.28■■□□□ 1.642e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.362e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.076e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-221ENST00000580180 753 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-38■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-43■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-43■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 NT5DC2-204ENST00000462261 1619 ntTSL 217.44■□□□□ 0.383e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 NT5DC2-210ENST00000479024 1714 ntTSL 216.1■□□□□ 0.173e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.34e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 PMPCA-204ENST00000444897 2316 ntTSL 217.77■□□□□ 0.444e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.974e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-207ENST00000533115 1077 ntTSL 336.49■■■■□ 3.434e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.214e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.974e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-202ENST00000526433 739 ntTSL 319.32■□□□□ 0.684e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.443e-12■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 AC012146.1-203ENST00000623522 1646 nt14.73□□□□□ -0.053e-12■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.373e-12■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.513e-12■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-13■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CSNK1G2-206ENST00000589861 756 ntTSL 528.17■■■□□ 2.14e-11■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CSNK1G2-211ENST00000615564 964 ntTSL 522.99■■□□□ 1.274e-11■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 GRAMD1A-207ENST00000598118 2277 ntTSL 1 (best)21.64■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.822e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.982e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.371e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 EIF2B2-207ENST00000556668 1011 ntTSL 210.98□□□□□ -0.651e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.045e-39■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-39■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.016e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.836e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.676e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 DDT-205ENST00000428792 333 ntTSL 28.71□□□□□ -1.026e-9■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 524.76■■□□□ 1.551e-323■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 11e-323■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.913e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-7■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.285e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 TESC-202ENST00000462502 854 ntTSL 525.68■■□□□ 1.73e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 TESC-208ENST00000552139 307 ntTSL 225.4■■□□□ 1.663e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 TESC-204ENST00000482176 841 ntTSL 324.14■■□□□ 1.453e-8■■■■□ 20.3
PABPC4Q13310 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.655e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.385e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 RNPEP-206ENST00000471105 2093 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.135e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.323e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.063e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.983e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-206ENST00000597333 726 ntTSL 217.59■□□□□ 0.417e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-205ENST00000596265 465 ntTSL 317.01■□□□□ 0.317e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-204ENST00000595530 582 ntTSL 214.87□□□□□ -0.037e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 FXR2-204ENST00000573057 675 ntTSL 214.36□□□□□ -0.113e-12■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 DMPK-215ENST00000598272 1410 nt30.65■■■□□ 2.55e-6■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 222.99■■□□□ 1.272e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MRPL11-202ENST00000329819 922 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MRPL11-204ENST00000524576 2209 ntTSL 212.35□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 MRPL11-203ENST00000430466 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 20.2
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