Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SCGB2A2Q13296 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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