Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM28Q13263 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
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