Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGDRQ13258 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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PTGDRQ13258 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDRQ13258 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms