Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NME3Q13232 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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