Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3BQ13214 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEMA3BQ13214 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3BQ13214 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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