Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-207ENST00000505185 225 ntTSL 29.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 49.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-208ENST00000431933 2673 ntTSL 59.12□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-209ENST00000434391 3338 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.024e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 HTT-205ENST00000509043 380 ntTSL 28.64□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-225ENST00000533087 582 ntTSL 58.45□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 28.4□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MARK3-225ENST00000561225 523 ntTSL 58.26□□□□□ -1.093e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.093e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DHDDS-207ENST00000430232 703 ntTSL 28.22□□□□□ -1.093e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-210ENST00000478006 746 ntTSL 38.07□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-205ENST00000520594 634 ntTSL 38□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 INTS10-212ENST00000522081 2333 ntTSL 27.98□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.62□□□□□ -1.193e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 HTT-212ENST00000513639 259 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MARK3-212ENST00000558223 908 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MARK3-220ENST00000560417 579 ntTSL 37.13□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 46.96□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 46.96□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-217ENST00000511652 470 ntTSL 36.87□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-205ENST00000554457 4730 nt6.8□□□□□ -1.323e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-203ENST00000520078 500 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 56.43□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-214ENST00000488107 416 ntTSL 56.14□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-204ENST00000467667 865 ntTSL 36.11□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 46.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 46.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 46.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-223ENST00000497579 878 ntTSL 35.93□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-204ENST00000547314 533 ntTSL 45.75□□□□□ -1.493e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TFDP2-205ENST00000471095 1004 ntTSL 25.7□□□□□ -1.53e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.53e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 INTS10-217ENST00000523846 704 ntTSL 35.27□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 45.18□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 HTT-211ENST00000513326 373 ntTSL 25.1□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFPM2-AS1-206ENST00000521622 394 ntTSL 34.73□□□□□ -1.653e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RAI14-210ENST00000507502 340 ntTSL 34.63□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 EIF2S1-203ENST00000554332 534 ntTSL 24.12□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PSMA6-213ENST00000556221 423 ntTSL 34□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 23.59□□□□□ -1.843e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 INTS10-214ENST00000522806 213 ntTSL 33.38□□□□□ -1.873e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TGFBR1-210ENST00000552573 526 ntTSL 42.75□□□□□ -1.973e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-201ENST00000352800 611 ntTSL 520.69■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-204ENST00000422442 564 ntTSL 519.72■□□□□ 0.754e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-203ENST00000422066 604 ntTSL 418.23■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-209ENST00000431421 550 ntTSL 418.23■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-219ENST00000627825 312 ntTSL 518.11■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 417.39■□□□□ 0.374e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 417.39■□□□□ 0.374e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-206ENST00000427349 554 ntTSL 316.4■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-210ENST00000431674 559 ntTSL 415.52■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 314.9□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 411.34□□□□□ -0.594e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-211ENST00000437738 565 ntTSL 57.62□□□□□ -1.194e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 57.35□□□□□ -1.234e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-205ENST00000424913 592 ntTSL 47.12□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 57.11□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-224ENST00000635794 768 ntTSL 56.69□□□□□ -1.344e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 45.33□□□□□ -1.564e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 45.28□□□□□ -1.564e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 54.95□□□□□ -1.624e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 TBL1XR1-232ENST00000637544 214 ntTSL 52.48□□□□□ -2.014e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 35.96□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.794e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AL033504.1-203ENST00000442094 404 ntTSL 33.28□□□□□ -1.884e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 23.05□□□□□ -1.924e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)7.69□□□□□ -1.182e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PTK2-215ENST00000519654 4129 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-7■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FAM126A-207ENST00000467005 542 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FAM126A-206ENST00000465661 525 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FAM126A-208ENST00000477349 544 ntTSL 410.36□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 21.3
TARDBPQ13148 CNOT2-207ENST00000547867 571 ntTSL 48.72□□□□□ -1.014e-10■■■■□ 21.3
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 534.2 ms