Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKRN3Q13064 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKRN3Q13064 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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