Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRDNQ13061 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRDNQ13061 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms