Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK2Q13002 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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