Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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BNIP1Q12981 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP1Q12981 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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