Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPN13Q12923 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN13Q12923 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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