Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMOD3Q0VAK6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms