Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SYCNQ0VAF6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SYCNQ0VAF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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