Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLEQ07864 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLEQ07864 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLEQ07864 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLEQ07864 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLEQ07864 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms