Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CKAP4Q07065 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms