Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EGR3Q06889 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms