Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX8Q06710 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX8Q06710 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms