Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIN1Q05586 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIN1Q05586 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms