Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4A11Q02928 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms