Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB1Q02818 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms