Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DSC2Q02487 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms