Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BDH1Q02338 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms