Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F1Q01094 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms