Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA4Q00056 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA4Q00056 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms