Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP2P81877 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms