Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUCB2P80303 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUCB2P80303 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms