Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms