Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB2AP61019 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms