Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFC1P60507 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms