Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA9P57773 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA9P57773 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA9P57773 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA9P57773 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms