Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP6P55212 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP6P55212 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP6P55212 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP6P55212 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP6P55212 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP6P55212 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms