Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNB3P54284 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms