Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LUMP51884 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LUMP51884 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LUMP51884 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LUMP51884 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LUMP51884 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms