Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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