Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPIAP49247 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPIAP49247 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPIAP49247 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms