Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TGM4P49221 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM4P49221 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms